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美媒:美國新冠病毒基因測序落后,許多數(shù)據(jù)來自幾個月前
(觀察者網(wǎng) 訊)新冠疫情在美國暴發(fā)以來,特朗普政府各應(yīng)對措施廣受批評。近期,變異新冠病毒病例出現(xiàn)在美國后,美媒注意到國內(nèi)疫情應(yīng)對的又一大缺陷——病毒基因測序。
美國有線電視網(wǎng)(CNN)1月11日撰文指出,根據(jù)病毒數(shù)據(jù)庫GISAID,美國不論是在病毒基因測序的比例上,還是速度上,都落后于很多國家。許多醫(yī)療資源落后于美國的國家,如孟加拉、蘇里南和斯里蘭卡,處理病毒樣本的速度都比美國快。
CNN:美國抓取的很多最新新冠病毒毒株數(shù)據(jù),來自于幾個月前
對此,醫(yī)學(xué)專家認(rèn)為這“很可悲”,并可能造成新病毒變種在人群中的廣泛傳播,政府卻對此毫不知情。并且,專家們還擔(dān)心,這可能造成疫苗失效。
樣本處理速度上,美國低于蘇里南
GISAID數(shù)據(jù)顯示,在從患者身上收集、分析并發(fā)布病毒樣本的速度方面,美國需要85天,排名世界第61位。許多醫(yī)療資源少得多的國家,包括孟加拉國、斯里蘭卡和蘇里南,處理樣本的速度比美國快。
對于美國病毒基因測序方面的落后,貝勒醫(yī)學(xué)院(Baylor College of Medicine)病毒學(xué)家彼得·霍特茲(Peter Hotez)博士說:“這很可悲。當(dāng)你需要等待85天的時候,一個基因序列可能已經(jīng)從一種罕見的變異,變成在一半人群中流行的病毒。”
美國疾控中心流感部前主任南希·考克斯(Nancy Cox)也表示:“當(dāng)許多國家都在做得更好,明顯更好時,我認(rèn)為這告訴我們,美國應(yīng)該齊心協(xié)力?!?
疾控中心先進(jìn)分子檢測辦公室主任格雷戈里·阿姆斯特朗(Gregory Armstrong)博士則辯解說,GISAID上的數(shù)據(jù)有延后,因此具有“誤導(dǎo)性”,但他也承認(rèn)美國在病毒基因測序上“仍需改進(jìn)”。
去年12月,洛杉磯一處新冠病毒檢測點 澎湃影像圖
阿姆斯特朗解釋說,在美國,疾控中心的實驗室、國家衛(wèi)生部門、私人公司和大學(xué)都在向GISAID提交序列?!爱?dāng)然,這并不意味著檢測周轉(zhuǎn)時間(TAT,指標(biāo)本采集到實驗室接收標(biāo)本的時間)不重要?!?
但CNN指出,美國在病毒基因測序上為人詬病,并不僅僅是因為時間上的拖延??紤]到病毒在美國的“猖獗程度”,美國基因測序的案例實在太少。
根據(jù)GISAID數(shù)據(jù),美國已經(jīng)繪制并發(fā)布了近7萬名新冠病毒感染的樣本,這一數(shù)字僅次于英國的15萬。然而,美國的新冠病例比其他任何國家都多,目前已超過2200萬例,遠(yuǎn)超世界其他國家。
因此,從測序數(shù)量的比例來看,美國出現(xiàn)了不足。根據(jù)GISAID數(shù)據(jù),美國每1000例病例內(nèi),只公布2.8個基因序列,落后于34個國家。從絕對比例來看,美國基因測序的病例,只占總病例的約0.3%,排名世界第43位。
GISAID最新數(shù)據(jù)綜合排名:美國每千病例的測序病例為2.78人,檢測時間中位數(shù)為84天
去年年底,美國每周大約對3000個樣本進(jìn)行測序。今年年初,美國疾病控制與預(yù)防中心制定了一個目標(biāo),在兩周內(nèi),美國實驗室發(fā)布的樣本數(shù)量應(yīng)該增加到每周6500個。
阿姆斯特朗說,1月2日至8日的那一周,美國的實驗室進(jìn)行了10619份樣本的測序,但其中只有1001份,于過去4周內(nèi)采集。
對此,考克斯悲觀地表示:“難道我們必須要在所有有關(guān)新冠肺炎疫情的事中墊底,或接近墊底嗎?我知道我們本可以做得更好,但卻沒有做得更好,這真的很令人沮喪。”
專家:基因測序是關(guān)鍵,可能影響疫苗
哈佛大學(xué)公共衛(wèi)生教授威廉·哈瑟?。╓illiam Haseltine)1月8日在福布斯上撰文指出,基因測序是識別病毒變異的關(guān)鍵,若測序不力,無法識別出新的毒株,那么不僅前景可怕,疫苗的使用和推廣也會受到影響。
哈瑟丁科普稱,基因組測序本質(zhì)能夠獲取DNA分子化學(xué)的堿基順序。科學(xué)家利用這些序列來識別基因、監(jiān)控指令,而在新冠病毒的案例下,能夠識別病毒突變。本次疫情早期的測序工作,幫助科學(xué)家們確定了病毒的結(jié)構(gòu),讓人們意識到這種病毒具有足夠的傳染性。而近期,測序工作也幫助人們識別了英國和南非出現(xiàn)的兩種變異病毒。
近一年來,新冠基因組學(xué)盟(Covid-19 Genomics Consortium)一直在跟蹤病毒的變化,記錄了超過15萬個病毒樣本。
但是在美國,基因測序工作卻非常滯后。美國已經(jīng)出現(xiàn)來自英國和南非的新毒株,這種傳播性表明,涉及這些變異病毒的病例已經(jīng)非常普遍。但美國缺乏基因組測序,使得變異逃避監(jiān)控。
哈瑟丁指出,病毒在每次傳播到新的宿主時都可能發(fā)生變異。全世界有數(shù)千萬的記錄病例,因此可能還有隱藏的新毒株沒有被發(fā)現(xiàn)。一些估計顯示,僅在美國,就有15-20%的美國人感染了新冠病毒,這使得美國病例衍生出一種新的變種,成為可能的情況。如果本土變異存在的話,這可能有助于解釋最近在假日季節(jié)觀察到的新冠病例激增。
一種更具傳染性的毒株在美國蔓延的前景已經(jīng)夠可怕的了,但如果有足夠多的變異,一種毒株可能會使目前的疫苗無效,這就是為什么必須加強尋找這些新毒株努力。如果部分人群具有新冠疫苗耐藥株,國家公共衛(wèi)生機構(gòu)就必須識別他們,并在此基礎(chǔ)上繼續(xù)疫苗研究。
最后,哈瑟丁表示,疫苗分發(fā)目前已開始推進(jìn),生活可能將在2021年恢復(fù)正常,但相反的情況也可能發(fā)生。美國和全世界都必須加強病毒基因的測序,識別和分離新毒株。否則,人類依舊將面臨非常漫長的一年。
本文系觀察者網(wǎng)獨家稿件,未經(jīng)授權(quán),不得轉(zhuǎn)載。
- 責(zé)任編輯: 趙挪亞 
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