-
最大規模中國人基因庫研究結果首次發表,漢族可分成7個亞群
最大規模中國人基因庫研究結果首次發表。
4月30日,瑞金醫院內分泌科領銜的ChinaMAP(中國代謝解析計劃)聯盟攜全國29家研究機構和醫院,在中科院上海生命科學研究院主辦的《Cell Research》雜志首次報道了對覆蓋全國27個省份和直轄市,8個民族,超過1萬人的高深度全基因組測序數據和表型的系統性分析。
研究團隊對隊列中代表中國不同地區和民族的10588人DNA樣本進行了40×深度全基因組測序,完成了高質量的中國人群遺傳變異數據構建、中國人群體結構分析、基因組特征比較以及變異頻譜和致病性變異解析。
此次發表意味著,通過中國人自己的儀器、平臺、分析方法,對中國人的基因組特征進行深入、廣泛的研究,具有前所未有的重要意義。
日本人群與中國北方漢族人群聚類完全重疊
為什么有些人喝酒臉紅,為什么有些人更容易患癌?其實,這些都與體內某些特定基因有關。
長期以來,中國人的很多遺傳疾病研究,都直接應用外國人的數據和結論。但由于不同地域人群和種族之間的歷史淵源和遺傳背景存在著巨大差異,如果把具有其他人群偏向性的知識和結論,直接拿來做為中國人的疾病風險評估、遺傳咨詢或診斷治療依據,并不完善、可靠。
國家代謝性疾病臨床醫學研究中心(上海)基于瑞金醫院牽頭開展的多項覆蓋全國的隊列研究,依托轉化醫學國家重大科技基礎設施(上海)和醫學基因組學國家重點實驗室,實施了中國代謝解析計劃ChinaMAP (China Metabolic Analytics Project)。
本文圖片均為“上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院”微信公眾號 圖
研究覆蓋中國七大地理區域,包括了人口排名前十的漢族、壯族、回族、滿族、苗族、彝族、藏族和蒙古族,顯示了中華民族跨地理區域人群遺傳背景的多樣性和復雜性。
研究團隊首次揭示了漢族人群可顯著分成7個亞群:北方漢族、西北漢族、東部漢族、中部漢族、南方漢族、東南漢族、和嶺南漢族。
少數民族中,藏族、彝族、蒙古族、苗族和壯族都有著獨特的人群聚類,而滿族和北方漢族相近,回族和西北、北方漢族相近。不同地域人群的變異特征也與中國歷史上的人口遷徙和變遷相關,例如河西走廊是絲綢之路中不同民族遷徙的交通要道,歷史上包括粟特人等許多民族曾在此經商生活。
瑞金醫院內分泌科主任王衛慶教授介紹,研究團隊對隊列中代表中國不同地區和民族的10588人DNA樣本進行了40×深度全基因組測序,完成了高質量的中國人群遺傳變異數據構建、中國人群體結構分析、基因組特征比較以及變異頻譜和致病性變異解析。在ChinaMAP一期數據庫中,包含1.36億個基因多態性位點SNP和1千萬個插入或缺失位點(NDEL),其中一半是在國際通用的多個數據庫中均沒有的新位點。
不少遺傳性疾病是寫在基因密碼中的。疾病相關變異位點在中國人群與歐美人群中的頻率存在差異,因此,中國的遺傳咨詢和解讀,對重要性不確定的基因變異(VUS)的研究,以及相關臨床指南和路徑制定,需要依據中國人自己的大樣本和高質量數據。
研究揭示,現代河西走廊地區的人們具有的基因多態性位點數量更多更復雜。與全世界其他人群相比,中國人的遺傳特征與歐洲、非洲、南亞和拉丁美洲人群之間存在著巨大差異,與非洲人群差距最大,而與東亞人群非常相似。研究者在成分分析中發現,日本人群與中國北方漢族人群聚類完全重疊。
山東人酒量并不突出
ChinaMAP對中國人的營養代謝和藥物代謝相關遺傳特征也進行了分析比較。
對受到廣泛關注的酒精代謝能力,從總體上看,北方人比南方人酒量相對更好,藏族、蒙古族、彝族人民和河南人酒量居于全國前列,山東人酒量并不突出,福建人和廣東人排在最后。
ChinaMAP證實,導致喝酒臉紅和酒精代謝能力差的乙醛脫氫酶2基因rs671變異是東亞人特異性的,在中國人群中的攜帶者(純合子比例4.50%,雜合子比例34.27%)遠高于全球其他人群。rs671變異也是誘發食管癌發生的重要風險因素,所以喝酒臉紅應少喝酒。
代謝性疾病,特別是Ⅱ型糖尿病和肥胖,已成為中國和世界范圍內發病率最高的重大慢病。但是,歐洲人群中最顯著的Ⅱ型糖尿病遺傳風險TCF7L2基因變異(如rs7903146)在中國人中的頻率卻很低,可見在代謝特征和疾病研究中,僅參考和驗證歐美人群的結果是不行的。
另外,一個人攜帶的某個基因變異產生的疾病風險可能并不大,但綜合多個基因變異的作用后對個體特征有重大影響。因此,基于特定人群的大規?;蛐秃捅硇蛿祿?,通過多基因風險評分(PRS)評估個體的疾病風險是一種比較準確的方法。
在ChinaMAP研究中,研究者對Ⅱ型糖尿病遺傳風險進行了多基因風險評分,以量化評分、年齡和血糖值的排序三維顯示了每個人在整個群體中的精確位置。多基因風險評分排名顯示了Ⅱ型糖尿病高風險和低風險的個體之間存在非常顯著的血糖差異,高風險個體隨著年齡的增加,空腹和餐后2小時血糖都顯著高于中風險和低風險者。
此外對比證實,基于東亞人群的基礎數據比基于歐洲人群的數據結果更加準確。這些結果提示,基于中國人群基礎數據對Ⅱ型糖尿病及其他代謝性疾病進行精確風險評估的重要性,對重大慢病的預防、個體化健康管理和公共衛生決策具有價值。
綜上所述,ChinaMAP以覆蓋中國各地區的研究隊列為基礎建立了高質量中國人群數據庫,通過高深度全基因組數據和精細表型分析,可為疾病機制研究、預防、遺傳咨詢和公共衛生管理提供依據。
- 原標題:最大規模中國人基因庫研究結果首次發表,漢族可分成7個亞群
- 責任編輯: 李天宇 
-
新聞多一點 | 習近平來到云岡石窟
2020-05-11 22:03 新時代新氣象新作為 -
習近平山西行丨首站來到大同西坪鎮
2020-05-11 22:01 新時代新氣象新作為 -
習近平山西行丨走進大同云岡石窟
2020-05-11 21:50 新時代新氣象新作為 -
習近平考察的黃花產業,如何助力脫貧攻堅
2020-05-11 21:49 新時代新氣象新作為 -
習近平赴山西考察調研
2020-05-11 21:06 -
國家衛健委:加強實驗室生物安全監管
2020-05-11 20:56 新冠肺炎抗疫戰 -
中國向新西蘭提出嚴正交涉
2020-05-11 19:45 臺灣 -
豐巢超時收費引發普遍不滿,上海消保委表態
2020-05-11 19:20 -
北京衛健委:小湯山醫院準備建立大型實驗室
2020-05-11 18:06 新冠肺炎抗疫戰 -
國民黨即將提出兩岸新論述,保留“九二共識”
2020-05-11 17:11 臺灣 -
任正非接受港媒采訪:我們一直在做6G,與5G同步
2020-05-11 17:03 華為 -
精準抓防控 堅定促發展
2020-05-11 16:26 新冠肺炎抗疫戰 -
習近平談防災減災:從源頭上防范 把問題解決在萌芽之時
2020-05-11 16:21 全國防災減災日 -
在國際護士節到來之際 習近平向全國廣大護士致以節日的祝賀和誠摯的慰問
2020-05-11 16:16 新時代新氣象新作為 -
陜西原書記趙正永被控受賄超7億,當庭認罪悔罪
2020-05-11 15:51 廉政風暴 -
因“截口罩”被問責的大理州州長,履新了
2020-05-11 15:22 -
香港有人縱火鬧事,反對派立法會議員鄺俊宇被拘捕
2020-05-11 15:21 香港 -
口罩下的迪士尼,見證滿血活力的上海
2020-05-11 14:43 新冠肺炎抗疫戰 -
疫情期間偷越國境賭博,福建兩名男子被判刑
2020-05-11 14:16 -
舒蘭市長:全面進入戰時狀態,將開展入戶大排查
2020-05-11 14:08 新冠肺炎抗疫戰
相關推薦 -
全國最大!哈密百萬千瓦“光熱+光伏”項目并網發電 評論 47“中國在非洲真正贏得了民心,就連斯威士蘭…” 評論 87“日企抱團是絕望之舉,中國工廠效率質量都是第一” 評論 132“她下月訪華,盡管特朗普團隊表達了擔憂” 評論 54最新聞 Hot
-
“沙特曾多次警告德國提防嫌疑人”
-
特朗普最新任命!這次包括火箭隊老板、真人秀制作人
-
巴勒斯坦三個政治派別發表聯合聲明
-
“中國在非洲真正贏得了民心,就連斯威士蘭…”
-
“日企抱團是絕望之舉,中國工廠效率質量都是第一”
-
“中國有能力讓夢想照進現實,將贏得史詩般競爭”
-
被災民暴罵到當場破防,馬克龍發飆:你該慶幸你在法國!
-
美高校敦促國際學生抓緊回來:萬一把中印拉黑名單呢
-
美國政府“逃過一劫”
-
“澤連斯基要求歐盟新外長:對華批評要降調”
-
澳大利亞來了,中國就得走人?澳總理這么回應
-
美媒感慨:基建狂魔發力,我們又要被超越了
-
英國剛公布新任大使,特朗普顧問就痛罵:傻X
-
“來自中國的老大哥能確保我們…”
-
俄羅斯的報復來了
-
澤連斯基罵普京“傻子”,俄方怒斥
-